Управление упразднено в соответствии с распоряжением Правительства Ростовской области от 20 апреля 2016 года № 163.
Функции по внутреннему государственному финансовому контролю в сфере бюджетных правоотношений и полномочия, закрепленные за органами внутреннего государственного финансового контроля субъектов Российской Федерации законодательством Российской Федерации о контрактной системе в сфере закупок товаров, работ, услуг для обеспечения государственных и муниципальных нужд, осуществляются министерством финансов Ростовской области.